В скором времени человечеству грозило полное уничтожение от вторжения загадочных созданий, именуемых «Фестумами». Оставшиеся представители человечества постоянно противостоят существам, стремящимся слить всех живых существ воедино. На тихоходном островке Тацумия, где долгие годы царила безмятежность, местные жители применили инновационные методы защиты малолетних от Фестумов, обеспечив им счастливое детство. Однако однажды такая оборона разрушается, ставя архипелаг перед лицом опасности.

Подростки из Тацумии теперь обязаны защищать своих родных от возможных угроз. На протяжении долгого времени островская генная биоинженерия целенаправленно совершенствовала у жителей навыки управления гигантскими военными механизмами, именуемыми Фафнирами. Эти юные бойцы, преждевременно ставшие взрослыми, превращаются в последнюю опору рода человеческого против угрозы Фестумов. Они идут через тернии ради спасения своей вселенной, готовые принести любые жертвы.