Специализированная группа сил самообороны охраняет гражданское население от гигантских монстров, регулярно атакующих Японию последние десятилетия. Остатки существ утилизируют специалисты по очистке, включая Кафку Хибино. Молодой человек испытывает разочарование по поводу своего текущего места работы – будучи юным, он мечтал поступить в Военизированный корпус, однако все его усилия оказались безуспешными. Вдруг перед ним открывается шанс исполнить заветную цель – чужеродное существо внедряется в его организм, наделяя Кафку способностью принимать облик монстра-кайдзю.